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办理石排镇医疗器械经营许可证需要以下步骤：

一、准备材料
1、营业执照副本复印件
需确保经营范围包含医疗器械相关内容。
2、法定代表人、企业负责人、质量负责人的身份证明、学历或者职称证明复印件
法定代表人和企业负责人需提供有效的身份证件；质量负责人应具备相关专业学历或职称，如医学、药学、生物工程等相关专业大专以上学历或中级以上技术职称。
3、组织机构与部门设置说明
明确各部门的职能和人员配置情况，例如采购部、销售部、质量管理部等。
4、经营范围、经营方式说明
经营范围要明确具体医疗器械产品类别（按照国家药品监督管理局发布的医疗器械分类目录），经营方式包括批发、零售或批零兼营等。
5、经营场所、库房地址的地理位置图、平面图（注明实际使用面积）、房屋产权证明文件或者租赁协议（附房屋产权证明文件）复印件
地理位置图清晰展示周边环境和交通状况；平面图准确标注各功能区域划分及面积；房屋产权证明或租赁协议合法有效且符合经营要求。
6、经营设施、设备目录
列出用于医疗器械储存、运输、销售等环节的设施设备，如货架、冷藏柜、温湿度监控设备等。
7、经营质量管理制度、工作程序等文件目录
包括采购管理、验收管理、库存管理、销售管理、售后服务管理等方面的制度和流程。
8、计算机信息管理系统基本情况介绍和功能说明
描述系统对医疗器械购销存全过程的记录、追溯等功能。

二、提交申请
1、向东莞市市场监督管理局石排分局提交上述材料。
2、提交方式可以是现场递交或通过网上申报平台上传电子文档。

三、现场核查
1、管理部门收到申请后，会安排工作人员对经营场所和库房进行现场核查。
2、核查内容包括：
经营场所和库房是否符合规定要求；
设施设备是否齐全并能正常使用；
质量管理制度是否健全并得到有效执行等。

四、审核发证
1、经过资料审查和现场核查合格后，管理部门会在规定时间内作出准予许可的决定，并颁发《医疗器械经营许可证》。
2、如果存在问题，会通知申请人限期整改，整改后再次核查直至合格为止。

整个办理过程可能需要一定的时间，建议提前准备好相关材料并严格按照要求操作。如果有不清楚的地方，可以咨询当地市场监督管理部门。